У системі ПАТ «НСТУ» функціонують 24 філії:
Вінницька філія
Волинська філія
Дніпровська філія
UA: Донбас
Житомирська філія
Закарпатська філія
Запорізька філія
Івано-Франківська філія
Київська філія
Кропивницька філія
UA: Крим
Львівська філія
Миколаївська філія
Одеська філія
Полтавська філія
Рівненська філія
Сумська філія
Тернопільська філія
Харківська філія
Херсонська філія
Хмельницька філія
Черкаська філія
Чернівецька філія
Чернігівська філія